การยับยั้งการทำงานของเชื้อไวรัสเป็นขั้นตอนแรกในบรรดาขั้นตอนต่างๆ ที่ออกแบบมาเพื่อเพิ่มความปลอดภัยให้แก่ผลิตภัณฑ์ชีววัตถุ ซึ่งโดยส่วนมากแล้วจะมีด้วยกัน 2 ขั้นตอน โดยระหว่างการยับยั้งการทำงานของเชื้อนั้น ไวรัสใดๆ ที่ปรากฏอยู่ภายในสารแขวนลอยสำหรับบำบัดโรคแบบรวมตัวอย่างและแบบกึ่งบริสุทธิ์จะถูกทำลายโดยเจตนาหรือกลายสถานะจนไม่สามารถก่อโรคได้ในทันที โดยมักจะกระทำผ่านการเปลี่ยนสภาพแวดล้อมรอบๆ ไวรัสเพื่อเป็นการยับยั้งและทำลายสภาพตามธรรมชาติของโครงสร้างของไวรัสไปอย่างไม่สามารถกู้คืนได้
โดยทั่วไปแล้ว ขั้นตอนนี้จะกระทำโดยการเปลี่ยนสภาพแวดล้อมรอบๆ ไวรัสเพื่อเป็นการยับยั้งและทำลายสภาพตามธรรมชาติของไวรัสไปอย่างที่ไม่สามารถกู้คืนได้ เช่น ด้วยวิธีทางเคมี ฟิสิกส์ หรือแม้แต่พลังงาน การกำจัดเชื้อไวรัสถือเป็นวิธีที่แยกต่างหากและแตกต่างจากการยับยั้งการทำงานของเชื้อไวรัส เนื่องจากวิธีนี้เป็นกระบวนการเสริมที่จะช่วยเพิ่มความปลอดภัยจากไวรัสได้โดยการลดหรือแยกไวรัสออกจากโปรตีนหรือผลิตภัณฑ์ที่ต้องการ