Poiché la pulizia è un processo dispendioso in termini di tempo che richiede una notevole esperienza da parte dell'operatore, la pulizia CIP (Clean in Place) è stata sviluppata per sistemi chiusi. Per CIP si intende la pulizia automatica di un sistema chiuso mediante il ricircolo di agenti detergenti a una temperatura e una concentrazione prestabilite. Il design igienico mantiene basso il volume delle fasi di miscelazione durante i cambi di prodotto e garantisce che gli agenti detergenti raggiungano tutte le superfici all'interno del sistema con la necessaria dinamica di flusso.

La pulizia COP (Cleaning Out of Place) viene utilizzata principalmente in sistemi così complessi, spesso a causa delle parti mobili, che possono essere puliti manualmente solo dopo lo smontaggio dei componenti. Il design igienico consente di smontare e rimontare o sostituire facilmente i componenti del sistema. Questo design rende tutte le superfici facilmente accessibili. Un esempio di design igienico in azione per un sistema COP sono i nastri trasportatori facilmente rimovibili. Ciò consente di sostituire un nastro trasportatore sporco con uno pulito anziché attendere che il nastro sporco venga pulito, riducendo così il tempo di fermo della produzione necessario per la pulizia.

Un design igienico di successo parte dalle cose semplici. La scelta degli strumenti deve essere appropriata per il processo. Se, come spesso accade, viene eseguita una pulizia a umido, il grado di protezione IP dei dispositivi deve essere sufficiente per il processo. Il materiale degli alloggiamenti deve resistere all'esposizione a lungo termine sia ai prodotti che agli agenti detergenti senza che la qualità o la levigatezza della superficie ne risentano. Gli impianti devono essere installati in modo tale da essere facilmente accessibili e raggiungibili durante le operazioni di pulizia.

Fattori come il design del telaio hanno un'influenza determinante in questo caso: un telaio aperto facilita l'accesso ai componenti del sistema e semplifica lo smontaggio per la pulizia. Anche i pavimenti, le pareti e gli scarichi a pavimento devono essere progettati di conseguenza. Tutte le superfici devono presentare una pendenza di circa 3° per evitare la formazione di pozzanghere e garantire il deflusso continuo dei liquidi. L'eventuale aggiunta di componenti al sistema non deve compromettere il concetto igienico originale.