Halogenacijska reakcija se pojavi, ko eden ali več atomov fluora, klora, broma ali joda nadomesti vodikove atome v organski spojini. Vrstni red reaktivnosti je fluor > klor > brom > jod. Fluor je še posebej agresiven in lahko silovito reagira z organskimi materiali. Prav tako se nagiba k temu, da je najbolj stabilen od organohalogenov in težko je odstraniti atom fluora, ko je enkrat dodan. Nasprotno pa je jod težje dodati organski molekuli, toda ko se oblikuje jodoorganski, se atom joda zlahka odstrani. Tako je elektronegativnost halogenskega atoma gonilna sila za halogenacijske reakcije. Reakcije so odvisne tudi od narave molekule substrata, ki se halogenira.
Halogenacije se pojavljajo z več različnimi procesi, odvisno od substrata: nasičeni ogljikovodiki halogenat s postopkom prostih radikalov; nenasičene organske halogenate z reakcijo adiciranja; aromati halogenat z elektrofilno substitucijo.
