Durante a sanitização por ozônio, é comum observar um aumento temporário nos níveis de TOC. Esse pico indica que o ozônio está decompondo efetivamente contaminantes orgânicos complexos em compostos orgânicos menores e subprodutos. Quando o ciclo de sanitização é concluído e o sistema é enxaguado, os níveis de TOC normalmente retornam ao valor de referência.

O ozônio reduz significativamente a contagem bacteriana ao inativar de forma eficaz bactérias, vírus e outros microrganismos, impedindo sua replicação. Após um ciclo de sanitização por ozônio, as contagens microbianas são substancialmente reduzidas ou até eliminadas. Isso pode ser claramente observado com um analisador de carga biológica em tempo real que exibe as contagens microbianas. As contagens em placas não conseguem detectar essa tendência no sistema de água com o mesmo nível de detalhe que um analisador de carga biológica, mas a correlação entre a ozonização e as contagens microbianas é clara.