Hücrelerde Stres Tepkisi Araştırması İçin Pipetler

Yaşam süreleri boyunca tüm organizmalar kısa ve uzun süreli streslere maruz kalır. Bunun sonucu olarak hücrelerin genomları, epigenomları ve proteomları hasar görebilir. Normal işlevin sürdürülmesi için bu hasarların onarılması gerekir. Ancak organizmalar yaşlandıkça, gerek normal aşınma ve yıpranmalara gerek aşırı sıcaklıklar ya da toksinler gibi sıra dışı streslere yanıt verme becerileri azalır.

California Üniversitesi'nin Berkeley kampüsünde bulunan Dillin laboratuvarında sürdürülen araştırma, organizmaların hücresel seviyede streslere nasıl tepki gösterdiklerine ve bu streslerin etkilerini nasıl azalttıklarına, yanı sıra da yaşlanan organizmalarda bu tür tepkilerin nasıl artırılacağına odaklanıyor. Çalışma, özellikle aralarında şeker hastalığı ve kanserin de bulunduğu ve ortaya çıkışları hasarlı stres tepkisiyle doğrudan bağlantılı olan yaşa bağlı hastalıkların daha sağlıklı yaşlanmayı sağlayacak şekilde nasıl azaltılabileceğini araştırıyor.

Dr. Ryo Higuchi-Sanabria, California Üniversitesi'nin Berkeley kampüsünde bulunan Dillin laboratuvarında

Dillin laboratuvarının çalışmasının önemli bir bileşeni, stres tepkisine etki eden genetik yolların keşfine yönelik. Laboratuvarda doktora sonrası araştırmacı olarak çalışan Ryo Higuchi-Sanabria, tam genom taraması ve hedef doğrulamasını kullanarak C. elegans (yuvarlak solucan) model sisteminde bu konuyu araştırıyor. Temel yaklaşım, C. elegans nematodlarının 96 veya 384 kuyucuk biçiminde depolanan RNAi kütüphanesine maruz bırakıldığı RNA etkileşimi (RNAi) taramalarıdır.

Kütüphanenin her bir kuyucuğu, yaklaşık 20.000 adet C. elegans geninden bir tanesini "işlevsiz hâle getiren" bir kutu içeriyor. Böylece, bu kutuyla işlenen nematodlar, kutunun karşılık geldiği RNA veya proteinin işlevinden etkin biçimde yoksun kalıyor. Ardından, nematodlar belirli türlerde stres uygulamalarına maruz bırakılıyor. Stres uygulanmasının ardından belirli bir gen ürününün işlevinden yoksun olan nematodların hayatta kalma şansı artar veya azalırsa söz konusu genin üzerinde bulunduğu genetik yol stres tepkisi üzerinde bir rol oynayabilir.

Stresle ilgili olmaya aday genler tarama yoluyla bir kez tanımlandıktan sonra, Dr. Higuchi-Sanabria ve çalışma arkadaşları, taranan nematodlarda o genin tanımının gerçekten "işlevsiz hâle getirildiğini" doğrulamak üzere nicel PCR metodunu kullanıyor. C. elegans'ın binlerce geni olduğu düşünüldüğünde; kütüphanelerin hazırlanması, taramaların ayarlanması ve aday genlerin doğrulanması işlemlerinin tümü büyük miktarda pipetleme gerektiriyor ve Dillin laboratuvarı bu konuda METTLER TOLEDO'nun Rainin çok kanallı pipetlerine güveniyor.

2018 yılında, METTLER TOLEDO ilk Bilimi Destekleme girişimini başlatarak, kazanana tercih edeceği pipeti sunmayı vadetti. Dr. Higuchi-Sanabria, daha önceden Dillin laboratuvarının müdürü Larry Joe ile ilave Rainin çok kanallı pipetleri satın alma konusunu görüşmüştü. Kendisi özellikle, bir kutuda bulunan mikrosantrifüj tüpleriyle 96 veya 384 kuyucuklu plakalar arasında örnekleri aktarma amacıyla kullanılabilecek, ayarlanabilir genişlikte çok kanallı bir pipetle ya da sınırlı örnekleri (3-12 μl) PCR şeritleri ile kuyucuk plakaları arasında doğru ve hassas biçimde transfer edebilecek, 2-20 μl hacimli çok kanallı bir pipetle ilgileniyordu.

Bunlardan birini ücretsiz olarak elde edebilecekleri umuduyla Joe, Dr. Higuchi-Sanabria'yı Bilimi Destekleme yarışmasına katılma konusunda cesaretlendirdi. Dr. Higuchi-Sanabria, barista olarak çalıştığı dönemdeki verimliliğini şu anda Dillin laboratuvarındaki deney üretim hızıyla karşılaştırdığı makalesiyle ödülü kazandı.

METTLER TOLEDO, Dr. Higuchi-Sanabria ve Dillin laboratuvarının, tarama olanaklarını ve doğrulama hızlarını doğru ve hassas şekilde artırırken aynı zamanda tekrar eden zorlamalardan kaynaklanan yaralanma riskini de barındırmayan, 2-20 μl elektronik çok kanallı pipeti tercih ettiğini duyurmaktan memnuniyet duyuyor.

İlgili Ürünler ve Çözümler