Dado que la limpieza es un proceso que requiere mucho tiempo y una gran experiencia por parte del operario, la limpieza in situ (CIP) se desarrolló para sistemas cerrados. La CIP consiste en la limpieza automática de un sistema cerrado mediante la recirculación de productos de limpieza a una temperatura y concentración definidas. El diseño higiénico mantiene bajo el volumen de fases mezcladas durante los cambios de producto y garantiza que los productos de limpieza lleguen a todas las superficies del sistema con la dinámica de flujo necesaria.

La limpieza fuera del lugar (COP) se utiliza principalmente en sistemas que son tan complejos, a menudo debido a las piezas móviles, que solo se pueden limpiar manualmente después de desmontar los componentes. El diseño higiénico facilita el desmontaje y el montaje o la sustitución de los componentes del sistema. Este diseño permite acceder fácilmente a todas las superficies. Un ejemplo de diseño higiénico en acción para un sistema COP son las cintas transportadoras fácilmente desmontables. De este modo, se puede sustituir una cinta transportadora sucia por una limpia en lugar de esperar a limpiar la sucia, lo que reduce la cantidad de tiempo que hay que detener la producción para la limpieza.

Un diseño higiénico eficaz empieza de forma sencilla. La selección de los equipos debe ser adecuada para el proceso. Si, como suele ser el caso, se realiza una limpieza en húmedo, el grado de protección IP de los dispositivos debe ser suficiente para el proceso. El material de las carcasas debe soportar la exposición a largo plazo tanto a los productos como a los agentes de limpieza sin deterioro de la calidad o la suavidad de la superficie. Los sistemas deben instalarse de forma que sean fácilmente accesibles y se pueda llegar a ellos durante la limpieza.

Factores como el diseño del bastidor tienen una gran influencia en este aspecto: un bastidor abierto facilita el acceso a los componentes del sistema y facilita el desmontaje para la limpieza. Los suelos, las paredes y los desagües del suelo también deben diseñarse en consecuencia. Todas las superficies deben tener una pendiente de aproximadamente 3° para evitar la formación de charcos y garantizar un drenaje o la evacuación continua de líquidos. Cualquier adición de componentes al sistema no debe diluir el concepto higiénico original.