Le COT est l'un des paramètres de qualité de l'eau les plus couramment utilisés, car il est à la fois rapide et non spécifique. Plutôt que de rechercher des contaminants individuels, une simple mesure du COT permet de quantifier la charge organique totale d'un système, offrant ainsi aux opérateurs une image immédiate de la pureté de l'eau. Lorsque les niveaux de COT dépassent les seuils acceptables, les conséquences peuvent être importantes.
Dans le domaine de l'eau pharmaceutique, les normes réglementaires telles que l'USP fixent une limite supérieure de 500 ppb, mais la plupart des fabricants appliquent des seuils internes beaucoup plus stricts, généralement autour de 25 ppb, avec des niveaux d'alerte définis bien avant que la limite réglementaire ne soit atteinte. Dans les applications liées aux semi-conducteurs et à la production d'électricité, les niveaux acceptables sont encore plus bas, souvent de l'ordre de quelques ppb seulement.
Des charges organiques élevées augmentent la demande en produits chimiques en aval, accélèrent l'encrassement des membranes d'osmose inverse et des équipements de purification, et peuvent entraîner un non-respect direct de la réglementation. Une détection précoce est donc essentielle pour protéger à la fois le processus et le produit final.