Il existe une multitude de causes de contamination possibles. Le métal, le plastique et le verre sont, de loin, les contaminants physiques les plus courants et s'introduisent en général des manières suivantes :
- Contamination des matières premières
- Introduction accidentelle par des salariés (p. ex. via les effets personnels)
- Procédures de maintenance réalisées sur ou à proximité de la chaîne de production ou de transformation
- Dysfonctionnement ou casse d'un équipement au cours du processus de production ou d'emballage