Pipety do badania reakcji komórek na stres

Każdy żywy organizm w ciągu swojego życia jest wystawiany na krótko- i długookresowy stres. Może on powodować uszkodzenia genomu, epigenomu i proteomu komórki, które w celu zachowania funkcjonalności muszą zostać naprawione. Jednak z biegiem czasu organizmy stopniowo tracą zdolność do reagowania zarówno na zjawiska spowodowane zwykłym zużyciem, jak i na nadzwyczajne obciążenia, takie jak wysoka temperatura czy toksyny.

Badacze z laboratorium Dillin na Uniwersytecie Kalifornijskim w Berkeley koncentrują się na reakcji organizmów na stres i łagodzeniu jego skutków na poziomie komórkowym, a także na sposobach stymulowania takich reakcji w starzejących się organizmach. W szczególności rozważają oni możliwość ograniczenia występowania chorób związanych z wiekiem, takich jak cukrzyca i choroby nowotworowe, które bezpośrednio wynikają z osłabienia reakcji na stres, co pozwoliłoby poprawić stan zdrowia osób w starszym wieku.

Dr Ryo Higuchi-Sanabria z laboratorium Dillin na Uniwersytecie Kalifornijskim w Berkeley

Duża część prac prowadzonych w laboratorium Dillin ma na celu odkrycie mechanizmów genetycznych zaangażowanych w reakcję na stres. Dr Ryo Higuchi-Sanabria, który odbywa w laboratorium podyplomowy staż naukowy, bada to zagadnienie na przykładzie organizmu modelowego nicienia, posługując się metodami przesiewu całego genomu oraz walidacji docelowej. Najważniejszą rolę odgrywa tu badanie interferencji RNA (RNAi), podczas którego nicienie C. elegans wystawia się na działanie biblioteki RNAi przechowywanej w formacie płytki 96- lub 384-komorowej.

W każdej komorze znajduje się zasobnik mogący wyciszyć jeden z około 20 000 genów C. elegans, pozbawiając organizm nicienia funkcji RNA lub kodowanego przezeń białka. Następnie nicienie poddaje się określonym rodzajom obciążeń. Jeżeli nicień pozbawiony funkcji produktu określonego genu wykaże następnie zwiększoną lub zmniejszoną przeżywalność, może to oznaczać odkrycie ścieżki odgrywającej pewną rolę w reakcji na stres.

Po zidentyfikowaniu metodą przesiewową kandydatów na geny związane z reakcją na stres dr Higuchi-Sanabria wraz ze współpracownikami sprawdza, czy ekspresja danych genów u badanych nicieni rzeczywiście została wyciszona, posługując się w tym celu techniką ilościowego PCR. Nicień ma tysiące genów, a badania wymagają przygotowania bibliotek, skonfigurowania przesiewania oraz weryfikacji wstępnie zakwalifikowanych genów. Wszystkie te czynności wymagają wielokrotnego pipetowania, do którego w laboratorium Dillin stosuje się pipety wielokanałowe Rainin METTLER TOLEDO.

W roku 2018 firma METTLER TOLEDO uruchomiła pierwszą edycję konkursu Supporting Science, którego zwycięzca mógł w nagrodę wybrać sobie dowolną pipetę. Dr Higuchi-Sanabria już wcześniej rozmawiał z kierownikiem laboratorium Dillin Larrym Joe o możliwości zakupu dodatkowych pipet wielokanałowych Rainin. Szczególnie interesowała go wielokanałowa pipeta o regulowanym rozstawie kanałów, która może być wykorzystywana do transferu próbek między probówkami mikrowirówkowymi w stojaku a płytkami 96- lub 384-komorowymi, a także pipeta wielokanałowa 2–20 µl, która pozwala precyzyjnie przenosić małe (3–12 µl) próbki między paskami probówek do PCR a płytkami komorowymi.

Larry Joe zachęcił dr. Higuchi-Sanabrię do udziału w konkursie Supporting Science w nadziei, że uda się bezpłatnie uzyskać jeden z tych modeli pipet. Dr Higuchi-Sanabria wygrał konkurs dzięki esejowi, w którym porównał swoją wydajność w wykonywanej niegdyś pracy baristy z wydajnością, jaką osiągał w trakcie eksperymentów w laboratorium Dillin.

METTLER TOLEDO ma przyjemność poinformować, że dr Higuchi-Sanabria wybrał elektroniczną pipetę wielokanałową 2–20 µl, która zapewni mu dokładność pipetowania i większą wydajność badań przesiewowych oraz weryfikacyjnych, a jednocześnie pozwoli uniknąć urazów wskutek powtarzających się obciążeń (RSI).

Produkty pokrewne