Поскольку очистка — это трудоемкий процесс, требующий значительных навыков от оператора, для закрытых систем была разработана очистка на месте (Clean in Place, CIP). CIP означает автоматическую очистку закрытой системы путем рециркуляции моющих средств при заданной температуре и концентрации. Гигиенический дизайн обеспечивает минимальный объем смешанных фаз при смене продукта и гарантирует, что моющие средства достигают всех поверхностей внутри системы с необходимой динамикой потока.

Очистка вне места (Cleaning Out of Place, COP) применяется преимущественно в системах, которые настолько сложны — часто из-за наличия движущихся частей — что их можно очистить только вручную после разборки компонентов. Гигиенический дизайн обеспечивает легкую разборку, сборку или замену компонентов системы. Такой дизайн делает все поверхности легко доступными. Примером гигиенического дизайна для системы COP являются легко снимаемые конвейерные ленты. Это позволяет заменить грязную ленту на чистую, не дожидаясь очистки грязной, что сокращает время простоя производства для очистки.

Успешный гигиенический дизайн начинается с простого. Выбор оборудования должен соответствовать процессу. Если – как часто бывает – проводится влажная очистка, степень защиты IP устройств должна быть достаточной для данного процесса. Материал корпусов должен длительно выдерживать воздействие как продуктов, так и моющих средств без ухудшения качества поверхности или её гладкости. Системы должны быть установлены так, чтобы к ним было легко получить доступ и до них можно было дотянуться во время очистки.

Такие факторы, как конструкция рамы, оказывают большое влияние – открытая рама облегчает доступ к компонентам системы и упрощает разборку для очистки. Полы, стены и сливные отверстия также должны быть соответствующим образом спроектированы. Все поверхности должны иметь уклон примерно 3°, чтобы предотвратить образование луж и обеспечить непрерывный слив или сток жидкостей. Любые добавления компонентов в систему не должны нарушать исходную гигиеническую концепцию.