토론토 University of Guelph의 종다양성 연구소 내에 있는 캐나다 DNA 바코딩 센터(CCDB, Canadian Centre for DNA Barcoding)는 국제 생물 바코드 프로젝트에 없어서는 안 될 필수적인 기관입니다. 이 프로젝트는 근위 표준 유전자 영역의 바코드 참조 데이터베이스를 생성하고 있습니다. 이 프로젝트의 목적은 5년 내에 500,000여 종 이상에서 추출한 5백만 개의 표본을 식별 및 발견하는 것입니다. 2009년부터 CCDB는 해마다 동식물 및 균류에서 약 300,000여 개의 샘플을 채취하여 분석하고 있습니다. 이러한 샘플들에 대해 일반적인 유전체학 실험 흐름에 따라 DNA 추출과 PCR 증폭 과정을 수행하고 있습니다. 하위 분석 방법은 약 650개의 염기쌍을 가진 COX 유전자로 구성된 동물 DNA 바코드의 순서를 결정하는 과정을 포함하고 있습니다. 식물 분석에는 rbcL 및 matK 엽록체 유전자가 사용됩니다.
제안 솔루션 Liquidator96Liquidator 96으로작업흐름가속화
선임 DNA 과학자 Natalia Ivanova 박사는 Rainin의 Liquidator 96이 어떻게 이러한 DNA 샘플을 처리하는 실험의 흐름을 가속화하는 데 도움을 주는지 설명합니다.
- “PCR 및 사이클 시퀀싱 설정에, 2 µL의 추출된 DNA를 사전 제작한 PCR 플레이트나 사전 제작한 시퀀싱 플레이트에 추가합니다. Liquidator 96을 사용하기 전에 8 또는 12채널 파이펫으로 실험하여 많은 시간을 소비했습니다.”
- “Liquidator 사용으로 파이펫팅 정확도가 크게 향상되고 오류가 줄어 들었습니다. 매일 20 ~ 40개의 PCR 플레이트를 처리한다고 가정하면 Liquidator는 반복적인 파이펫팅과 관련된 손목 부상 위험을 최소화합니다. 팁 로딩과 언로딩은 매우 쉽고, 인체공학적이며, 효율적입니다.”
- “Liquidator는 로봇자동자치의 효율과 수동 작업의 간단함을 잘 결합했습니다. 액체 처리 로봇장치와 비교하여 길고 복잡한 교육이 필요하지 않습니다. 사용방법이 매우 간단하고 어느 사용자든 간단한 교육을 통해 실험실의 누구나 Liquidator를 사용할 수 있습니다.”
- “Liquidator는 96웰 플레이트당 1.5 – 2분의 시간을 절약합니다. 많은 양의 샘플을 처리하기 때문에 연간 누적 노동비 절감은 $5,000 이상이 될 수 있습니다. 기술자 피로 및 여러 작은실수로 인한 오류 수정에 필요한 노동력 및 시약의 절감으로 이러한 비용 절감이 쉽게 두 배 또는 세 배로 증가될 수 있습니다. Liquidator는 현명한 투자입니다.”