Az ontario-i Guelph Egyetem Biodiverzitási Intézetében működő Kanadai DNS-Vonalkód Központ (Canadian Center for DNA Barcoding, CCDB) részt vesz a nemzetközi, „Az élet vonalkódja” elnevezésű projektben. A projekt referencia adatbázist állít fel a rövid standardizált génrégiókról. A küldetésüket így fogalmazták meg: „5 éven belül szeretnénk 5 millió mintát gyűjteni több mint 500 ezer fajból.
A központ 2009 óta kb. 300 000 állati, növényi és gomba mintát dolgozott fel évente. Amint a minták bekerülnek a CCDB-be, mindegyikük egy tipikus genomikai folyamaton esik át: a DNS kivonása után a PCR-amplifikálásra kerül sor. Állatok esetén a downstream analitikai módszerek a COX gén 650 bázispárból álló DNS szakaszának szekvenálását is magukban foglalják. Növények esetén kloroplasztisz géneket (rbcL és matK) használnak
Javasolt megoldás Liquidator96
A munkafolyamat felgyorsítása a Liquidator 96-tal
Dr. Natalia Ivanova, vezető DNS-kutató bemutatja, hogyan gyorsítja meg a Rainin Liquidator 96 készüléke a DNS-minták feldolgozását:
- “A PCR és ciklikus szekvenálási beállítások során 2 µl-nyi extrakt DNS-t adunk az előkészített PCR-lemezhez, vagy szekvenáló lemezekhez. Korábban 8- és 12-csatornás pipettákkal dolgoztunk, most mindez sokkal gyorsabban elvégezhető a Liquidator 96-tal.”
- “A Liquidator használatával a pipettázási pontosság jelentősen növekedett, és csökkent a hibák száma is. Mivel minden nap kb. 20-40 PCR-lemezt dolgozunk fel, a Liquidator használata jelentősen csökkentette a csuklósérülések előfordulását is, ami a sok pipettázás miatt alakulhat ki. A hegy felhelyezése és ledobása nagyon egyszerű, ergonomikus és hatékony módon történik.”
- “A Liquidator robotikus hatékonyságot kínál a manuális kezelhetőség egyszerűségével kombinálva. Nem igényel hosszú és bonyolult betanítást, mint amilyen pl. a folyadékkezelő robotokhoz szükséges. Egyetlen gyors oktatás után már az egész labor használta a Liquidator-t.”
- “A Liquidator használatával akár 1,5 – 2 percet is megtakaríthatunk minden 96-os lemez esetén. Mivel igen sok mintát dolgozunk fel, a laborköltségek csökkenése akár az évi 5000 dollárt is elérheti. A korábban a technikusok fáradsága miatt elkövetett hibák kijavítására használt labor- és reagensköltségek a felére, sőt a harmadára csökkentek. A Liquidator számunkra igen bölcs beruházásnak bizonyult.”
Nézze meg a Liquidator 96 használatát a CCDB-nélTöltse le tanulmányunkat: "A genomikus munkafolyamatok egyszerűsítése a CCDB-nél - aLiquidator 96 használata a DNS-vonalkódozásnál"