Il existe de nombreuses façons de mesurer la contamination microbienne de l’eau, et l’USP recommande des méthodes spécifiques pour les eaux pharmaceutiques.
Traditionnellement, les méthodes de dénombrement sur gélose sont largement utilisées pour la libération de l’eau ; toutefois, elles sont sujettes aux erreurs et peuvent nécessiter 5 à 7 jours pour obtenir des résultats. Le dénombrement sur plaque exige également la formation d’une colonie bactérienne sur une plaque, et c’est pourquoi l’unité de mesure est appelée « unité formant colonie » ou UFC, laquelle estime le nombre total de bactéries présentes dans l’échantillon de la plaque.
Une autre façon de mesurer la contamination microbienne de l’eau consiste à utiliser la fluorescence induite par laser avec un analyseur de détection microbienne. Ces analyseurs utilisent une technologie de fluorescence induite par laser pour mesurer le nombre total de cellules présentes dans le volume d’eau échantillonné. Les systèmes qui utilisent cette technologie permettent une surveillance en ligne, en temps réel, de la contamination microbienne des eaux pharmaceutiques en identifiant immédiatement les cellules présentes dans l’échantillon d’eau, et les résultats sont exprimés en unités auto-fluorescentes (AFU).