Flux de travail rationalisés pour les projets de barcode ADN - METTLER TOLEDO

Flux de travail rationalisés pour les projets de barcode ADN

Flux de travail rationalisés pour les projets de barcode ADN
Flux de travail rationalisés pour les projets de barcode ADN

Situé à l'Institut de la biodiversité de l'Université de Guelph, à Toronto, le centre CCDB fait partie intégrante du Projet international du code barre du vivant (International Barcode of Life Project). Celui-ci a pour vocation de créer une base de données de codes barresde régions de gènes courtes et standardisées. Sa mission : l'identification et la découverte de 5 millions de spécimens appartenant à plus de 500 000 espèces en 5 ans.

Depuis 2009, le Centre a traité environ 300 000 échantillons par an provenant de sources animales, végétales ou fongiques. Une fois au CCDB, les échantillons sont traités selon le processus génomique courant : extraction d'ADN et amplification PCR. Les méthodes d'analyse en aval incluent le séquençage de codes barres ADN pour les animaux, qui comprennent environ 650 paires de bases de gènes COX. Pour les végétaux, les gènes chloroplastiques rbcL et matK sont utilisés.

 

Solution proposée Liquidator96


Accélération du flux de travail à l'aide du Liquidator 96
Rainin Liquidator96 Dr Natalia Ivanova, responsable scientifique ADN, explique comment le Liquidator 96 de Rainin aide à accélérer le flux de travail lors du traitement de ces échantillons :

  • “Pour la configuration de la réaction PCR et du séquençage de cycle, 2 (deux) µl d'ADN extrait sont ajoutés à la plaque PCR préparée ou aux plaques de séquençage préparées. Avant de découvrir le Liquidator 96, nous utilisions des pipettes à 8 ou 12 canaux pour le transfert ce qui était beaucoup plus fastidieux.”
  • “L'utilisation du Liquidator a considérablement amélioré la précision du pipetage et réduit le nombre d'erreurs. Étant donné que nous traitons environ 20 à 40 plaques PCR par jour, le Liquidator minimise le risque de blessures au poignet associé au pipetage répété. Le processus de chargement et de déchargement des cônes est relativement simple, ergonomique et efficace.”
  • Le Liquidator est le mariage de l'efficacité robotisée et de la simplicité de la manipulation manuelle. Il ne nécessite pas de sessions de formation longues ou compliquées (par exemple en comparaison aux robots de traitement des liquides). La courbe d'apprentissage était très rapide et après une seule démonstration, toute l'équipe a pu commencer à utiliser le Liquidator.”
  • Le Liquidator permet un gain de temps de 1,5 à 2 minutes pour 96 puits. Avec un grand volume d'échantillons traités, les économies peuvent atteindre jusqu'à 5000 $ par an. Des économies indirectes en temps de travail et réactifs qui seraient nécessaires pour corriger des erreurs dues à la fatigue d'un technicien et au facteur humain peuvent facilement représenter le double ou le triple de ces économies. Le Liquidator a été un investissement judicieux.”