Kanadské středisko pro značení DNA čárovými kódy – neboli CCDB – se sídlem v Ústavu pro biologickou rozmanitost při Guelphské univerzitě je nedílnou součástí mezinárodního projektu Čárový kód života. Cílem projektu je vytvořit referenční databázi čárových kódů pro krátké, standardizované oblasti genů. Mise střediska: identifikace a odkrytí pěti milionů vzorků od více než 500 000 živočišných a rostlinných druhů během pouhých 5 let.
Středisko již zpracovalo přibližně 300 000 vzorků živočišného, rostlinného a plísňového materiálu. Jakmile vzorky dorazí do CCDB, jsou podrobeny typickému genomickému procesu s extrakcí DNA a následnou amplifikací pomocí PCR. Mezi další analytické metody se řadí sekvencování čárových kódů živočišné DNA, která obsahuje přibližně 650 párů bází genu COX. Chloroplastové geny se používají u rostlin, rbcL a matK.
Doporučené řešení Liquidator96
Rychlejší práce díky přístroji Liquidator 96
Dr. Natalia Ivanovová, vedoucí výzkumná pracovnice v oblasti DNA, vysvětluje, jak přístroj Rainin Liquidator 96 pomáhá zrychlit zpracovávání těchto vzorků DNA:
- “Při přípravě PCR a cyklického sekvencování přidáváme 2 µl extrahované DNA na připravenou PCR destičku nebo sekvenční destičku. Než jsme mohli pracovat s přístrojem Liquidator 96, používali jsme pro přenos 8kanálové nebo 12kanálové pipety, což bylo mnohem pracnější.”
- “Nasazení přístroje Liquidator nám výrazně pomohlo zvýšit přesnost pipetování a snížit počet chyb. Každý den zpracováváme 20–40 destiček, takže přístroj Liquidator nám pomáhá minimalizovat i riziko poranění zápěstí v důsledku opakovaného pipetování. Upevnění a shození špičky je zcela jednoduché, velmi ergonomické a účinné.”
- “Přístroj Liquidator představuje příjemnou kombinaci efektivity robotizovaného systému a jednoduchosti manuální manipulace. Nevyžaduje zdlouhavé a složité zaškolování (na rozdíl například od manipulačních robotů). Zaškolení bylo opravdu rychlé: po jediném předvedení mohla přístroj Liquidator začít používat celá laboratoř.”
- “Přímá úspora času při použití přístroje Liquidator činí 1,5–2 minuty u každé 96jamkové destičky. Při počtu vzorků, které zde zpracováváme, činí úspory nákladů v naší laboratoři více než 5 000 USD ročně. Jestliže připočítáme i úspory v oblasti pracnosti a nákladů na reagenty, které by bez přístroje Liquidator byly nezbytné ke korekci lidské chyby, dostáváme se snadno na dvojnásobek nebo trojnásobek této částky. Přístroj Liquidator představuje nadmíru rozumnou investici.”
Podívejte se na přístroj Liquidator 96 v akci v laboratoři CCDB Stáhněte si Bílou knihu: "CCDB zjednodušuje genomický proces Použití přístroje Liquidator 96 v označování DNA čárovými kódy"